孤岛惊魂6密码箱1的位置在圣所岛(初始岛屿)，具体位置在基多-文图拉高峰，密码箱位于和睦村的西北边，密码表的位置非常靠近密码箱，一个在房顶上，另一个在房子右侧的管子里。